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Représentation des connaissances en pneumologie : l’ontologie doit pouvoir aider au codage - 21/09/10

Doi : 10.1016/j.rmr.2010.06.012 
F.-X. Blanc a, , A. Baneyx b, c, J. Charlet c, B. Housset d
a Unité fonctionnelle de pneumologie, service de médecine interne, CHU Bicêtre, AP–HP, 78, rue du Général-Leclerc, 94275 Le Kremlin-Bicêtre, France 
b IFRIS, LATTS UMR CNRS 8134, université Paris-Est, 77455 Marne-la-Vallée, France 
c Inserm UMRS 872, équipe 20, centre biomédical des Cordeliers, 75006 Paris, France 
d Service de pneumologie et de pathologie professionnelle, CHI, 94010 Créteil, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

Introduction

L’accès aux connaissances médicales est un enjeu majeur pour les professionnels de santé et passe par le développement de terminologies. Notre objectif consiste à mettre au point une ontologie de la pneumologie, c’est-à-dire une certaine organisation et formalisation des connaissances dans ce domaine. Le but est de faciliter le codage médico-économique hospitalier et la représentation de connaissances pertinentes relatives au patient.

Méthodes

Nos recherches couvrent l’ensemble du cycle de vie d’une ontologie depuis la mise au point d’une méthodologie de construction à partir de textes jusqu’à son utilisation dans un système opérationnel. Un outil informatique, reposant sur l’ontologie, propose non seulement un codage médico-économique mais aussi médical qui pourra servir à terme de descripteur pour indexer intelligemment les comptes rendus d’hospitalisation.

Résultats

Notre ontologie compte 1913 concepts et contient l’ensemble des connaissances contenues dans la partie PMSI du thésaurus de spécialité de la SPLF. L’évaluation de l’outil montre un rappel de 80 % et une précision de 85 % sur le codage médico-économique.

Conclusion

Le travail présenté ici permet de justifier l’approche retenue. Il doit être poursuivi pour valider à grande échelle les principes des codages proposés et la possibilité d’effectuer des requêtes intéressant la recherche clinique.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Introduction

Access to medical knowledge is a major issue for health professionals and requires the development of terminologies. The objective of the reported work was to construct an ontology of respiratory medicine, i.e. an organized and formalized terminology composed by specific knowledge. The purpose is to help the medico-economical coding process and to represent the relevant knowledge about the patient.

Methods

Our researches cover the whole life cycle of an ontology, from the development of a methodology, to building it from texts, to its use in an operational system. A computerized tool, based on the ontology, allows both a medico-economical coding and a graphical medical one. This second one will be used to index hospital reports.

Results

Our ontology counts 1913 concepts and contains all the knowledge included in the PMSI part of the SPLF thesaurus. Our tool has been evaluated and showed a recall of 80 % and an accuracy of 85 % regarding the medico-economical coding.

Conclusion

The work presented in this paper justifies the approach that has been used. It must be continued on a large scale to validate our coding principles and the possibility of making enquiries on patient reports concerning clinical research.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Ontologie, Extraction terminologique, Ingénierie des connaissances, Codage médico-économique, Pneumologie

Keywords : Ontology, Terminology extraction, Knowledge engineering, Medico-economic coding, Respiratory medicine


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© 2010  Publié par Elsevier Masson SAS.
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Vol 27 - N° 7

P. 741-750 - septembre 2010 Retour au numéro
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