Analyses automatisées à haut-débit de la morphométrie pulmonaire : une présentation de la puissance de l’outil - 21/12/15

Les pathologies pulmonaires comme la dysplasie bronchopulmonaire (DBP) chez le nourrisson et l’emphysème affectent les structures du poumon en fonction du stade et de la sévérité de la maladie. Les études morphométriques actuelles des poumons adultes et néonataux impliquent des étapes manuelles qui demandent beaucoup de temps et introduisent une variabilité due à l’opérateur. Nous avons ainsi développé une méthode d’analyse morphométrique totalement automatisée éliminant la variabilité liée à l’opérateur et le temps nécessaire pour réaliser les études [1Sallon C., Soulet D., Provost P.R., Tremblay Y. Automated high-performance analysis of lung morphometry Am J Respir Cell Mol Biol 2015 ;  53 (2) : 149-158 [cross-ref]

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Cette approche a été développée sous MATLAB et est utilisée pour suivre les changements dans les structures pulmonaires pendant la formation des saccules/alvéoles et la septation, et caractériser les changements induits par l’exposition de nouveau-nés à l’hyperoxygénation, un modèle reconnu de DBP.

L’analyse par ordinateur réalisée à partir d’images de sections de poumon complet fourni de nouvelles données morphométriques qui ne peuvent pas être obtenues par la méthode manuelle. De plus, la proportion de tissu analysée peut être augmentée puisque notre approche est très rapide et beaucoup plus de paramètres peuvent être obtenus avec une reproductibilité très élevée.

Nous avons ainsi développé une méthode complète allant de la préparation des échantillons jusqu’à l’obtention et l’analyse des données morphométriques. Ce nouvel outil est très rapide, très précis, et fourni de nouveaux paramètres morphométriques permettant une compréhension plus approfondie des structures pulmonaires en relation à différentes pathologies.