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Diagnostic virologique des infections respiratoires basses - 29/01/21

Virological diagnosis of lower respiratory tract infections

Doi : 10.1016/j.rmr.2020.11.002 
S. Pillet a, , b , M. Gueudin c, d, J.C. Plantier c, d, A. Vabret d, e
a Laboratoire des agents infectieux et d’hygiène, faculté de médecine de Saint-Étienne, CHU de Saint-Étienne et GIMAP EA3064, 1, avenue Albert-Raimond, 42055 Saint-Étienne cedex 2, France 
b GIMAP EA 3064, faculté de médecine de Saint-Étienne, campus santé innovations, 10, rue de la Marandière, 42270 Saint-Priest-en-Jarez, France 
c UNIROUEN, GRAM EA2656, laboratoire de virologie, Normandie université, CHU de Rouen, 76000 Rouen, France 
d Fédération Normande en microbiologie, infectiologie, hygiène (FéNoMIH), CHU de Caen et de Rouen, 14000 Caen, France 
e UNICAEN, GRAM EA2656, laboratoire de virologie, Normandie université, CHU de Caen, 14000 Caen, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

Introduction

Le diagnostic étiologique des infections bronchopulmonaires ne peut se faire sur les seules données cliniques, radiologiques et épidémiologiques. La part importante des infections virales chez l’adulte et chez l’enfant est démontrée.

État des connaissances

Le diagnostic des infections bronchopulmonaires virales repose sur l’analyse d’un prélèvement respiratoire, de préférence profond, par des techniques qui détectent soit les virus grippaux et le virus respiratoire syncytial, soit un large panel d’agents susceptibles d’être responsables de la pathologie. Ces dernières, appelées techniques de PCR multiplex, permettent une approche syndromique de l’infection respiratoire. Leur coût élevé pour le laboratoire pose la question de leur place dans la prise en charge des patients en termes d’épargne antibiotique et d’isolement. Devant l’absence de recommandation, la stratégie et l’équipement sont très hétérogènes.

Perspectives

La place de ces tests dans la prise en charge des patients doit être évaluée par des études médicoéconomiques. Le rôle des différents virus, souvent détectés en coinfection, en particulier chez les enfants, mérite également l’attention des virologues et des cliniciens.

Conclusions

Les nouvelles technologies de diagnostic, l’émergence du coronavirus SARS-CoV-2 et la mise sur le marché de nouveaux antiviraux vont impacter les recommandations de la prise en charge de ces infections.

El texto completo de este artículo está disponible en PDF.

Summary

Introduction

The etiological diagnosis of bronchopulmonary infections cannot be assessed with clinical, radiological and epidemiological data alone. Viruses have been demonstrated to cause a large proportion of these infections, both in children and adults.

Background

The diagnosis of viral bronchopulmonary infections is based on the analysis of secretions, collected from the lower respiratory tract when possible, by techniques that detect either influenza and respiratory syncytial viruses, or a large panel of viruses that can be responsible for respiratory disease. The latter, called multiplex PCR assays, allow a syndromic approach to respiratory infection. Their high cost for the laboratory raises the question of their place in the management of patients in terms of antibiotic economy and isolation. In the absence of clear recommendations, the strategy and equipment are very unevenly distributed in France.

Outlook

Medico-economic analyses need to be performed in France to evaluate the place of these tests in the management of patients. The evaluation of the role of the different viruses often detected in co-infection, especially in children, also deserves the attention of virologists and clinicians.

Conclusions

The availability of new diagnostic technologies, the recent emergence of SARS-CoV-2, together with the availability of new antiviral drugs are likely to impact future recommendations for the management of viral bronchopulmonary infections.

El texto completo de este artículo está disponible en PDF.

Mots clés : Réaction de polymérisation en chaîne multiplex, Infections de l’appareil respiratoire, Infections communautaires, Pneumopathie virale, Co-infection

Keywords : Multiplex Polymerase Chain Reaction, Respiratory Tract Infections, Community-Acquired Infections, Pneumonia, Viral, Co-infection


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Vol 38 - N° 1

P. 58-73 - janvier 2021 Regresar al número
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