Difficultés et limites dans la conduite d’une étude translationnelle en oncologie thoracique. Un exemple pratique - 21/09/16

Dans une étude princeps, nous avons trouvé que des signatures composées de trois ARNm (sémaphorine 3D [SEMA3D], cytokératine 16 [KRT16] et UL16 binding protein 2 [ULBP2]) étaient associées à la réponse à la chimiothérapie par cisplatine-vinorelbine et à la survie des cancers bronchiques non à petites cellules avancés (CBNPC).

Le but de la présente étude a été de développer des tests immunohistochimiques pour KRT16, ULBP2 et SEMA3D et de tester l’expression de ces protéines pour la prédiction de la réponse et de la survie sur des biopsies provenant des mêmes patients que ceux inclus dans l’étude du transcriptome.

Nous n’avons pas pu reproduire par l’étude de l’expression protéique en immunohistochimie la signature de réponse à une chimiothérapie de CBNPC avancés, signature que nous avions identifiée sur le transcriptome par des techniques de biologie moléculaire à haut débit dans la première phase de notre étude.

Nous mettons en évidence les difficultés de la recherche translationnelle en oncologie thoracique en soulignant la complexité d’obtention de prélèvements tissulaires adéquats et les difficultés de réalisation et transposition en routine des techniques d’analyse transcriptomiques à haut débit.

In a first study, we identified signatures of 3 mRNAs (semaphorin 3D [SEMA3D], cytokeratin 16 [KRT16] and UL16 binding protein 2 [ULBP2]) associated to response to a cisplatin-vinorelbin chemotherapy and to survival of advanced non-small cell lung cancers (NSCLC).

The aim of this study was to develop immunohistochemistry tests for KRT16, ULBP2 and SEMA3D and to test proteins expression for prediction of response and survival in biopsies of the same patients.

We were not able to reproduce by the protein expression study the signature predicting response to chemotherapy in advanced NSCLC.

We highlight the difficulties of translational research in thoracic oncology emphasizing the complexity in obtaining adequate tissue samples and the difficulties in conduction and transposing in routine practice high throughput technique for transcriptomic analyses.